Puigal hakati haridust andma aastal 1991, kui siin alustas tööd Võrusoo Põhikooli filiaal. Esimesse klassi läks toona 19 õpilast ja nende klassijuhatajaks sai õpetaja Ruth Veske. I klass võeti vastu Võrusoo Põhikoolis, kuid esimene tund toimus Puigal. Kevadel lahkus neli õpilast linnakooli.
Järgmisel õppeaastal 1992/1993 alustas haridusteed 8 õpilast, klassijuhatajaks oli neil õpetaja Anneli Laansalu. Kool tegutses Soo kooli filiaalina Puiga lasteaiaga ühes majas. Peagi jäid ruumid kooliõpilastele ja lasteaialastele kitsaks.
1993. a tuli esimesse klassi 12 õpilast ja klassijuhatajaks oli õpetaja Kersti Kattai. Kool jätkas Puiga Lasteaed-Algkooli nime all. Alates sellest õppeaastast toimus õppetöö kahes vahetuses: hommikul ja õhtul.
1994/95 õppeaastal liideti I ja III klass. Klassijuhatajana jätkas õpetaja A. Laansalu.
Lasteaia ruumid jäid koolile järjest kitsamaks. Taheti teha juurdeehitus või ehitada lasteaiale peale teine korrus, kuid leiti et maja vundament on selleks liiga nõrk.
Lasteaia majaga jäeti hüvasti ja liiguti rongkäiguna koolimaja juurde, kus pidulikult lõigati läbi lint. Avati kooli nimesilt. Meeleolu loomiseks mängis orkester ja laulis Kolepi segakoor.
Puiga Algkooli juhatajaks sai Anneli Laansalu. Majandusjuhataja oli Arno Tolga. Sel ajal ei olnud veel koolil oma sööklat. Söömas käidi lasteaias. Kooli avamisel osalesid ka Võru vallavanem Helgi Riigov ja vallavolikogu esimees Heino Kuusik. Tema sooviks oli mõne aasta pärast avada Puigal juba põhikool. Kooli valmimisele aitasid kaasa OÜ Ehitaja, AS Kurmik ja OÜ Torel. Aktus lõppes tammepuukese istutamisega. Kooliteed alustas 55 õpilast.
1999. a suvel kohandati kooli saal ümber võimlaks, kohaks, kus sai ka palli mängida. Loodi ka Puiga ajaloo esimene korvpallimeeskond. Esimene treener oli Sulev Kraam. 2000. a ehitati koolimaja juurde korralik korvpalliplats.
2001. a lõpetas põhikool esimene lend 12 õpilasega. Klassijuhataja oli Helgi Moisto.
17. novembril 2003. a valmis Puiga Põhikooli teine juurdeehitus. Puiga kool oli esimene 21. sajandi kooli programmis ehitatud koolimaja. Riik toetas juurdeehitust 1,3 miljoni krooniga, Võru vald 2 miljoni krooniga. Kool sai tänu juurdeehitusele suurema söögisaali, garderoobid, muusikaklassi ning eesti keele ja loodusainete kabineti. Koolimaja juurdeehituse ehitas OÜ Selista Ehitus. Lindi läbilõikamisel osalesid haridus- ja teadusminister Toivo Maimets, maavanem Mait Klaassen ja volikogu esimees Priit Süüden.
Kahel suvel, 2003. ja 2004. a, toimus Puiga Põhikoolis töö- ja puhkelaager. Laagri koordinaator oli õpetaja Kersti Kattai.
18. mail 2005. a avati kooli keldrikorrusel 7 trenažööriga jõusaal.
2005. a valmis õpetaja Avo Aia eestvedamisel metalliklass.
Kool sai III juurdeehituse 2008. a oktoobris. Valmis sai uus täismõõtmetega spordihoone, treeneriruum, riietusruumid koos saunadega ja jõusaal. Valmis ka uus nõuetekohane arvutiklass, inglise keele klass ja logopeedi ruum.
Õpilaste arv on Puiga Põhikoolis kasvanud aastate jooksul 55-lt (sept.1995) kuni 186-ni (sept.2017), olles üks väheseid kasvava õpilaste arvuga maakoole Võrumaal.
Direktorid:
1995 – 1998 Anneli Laansalu
1998 – 2002 Astrid Org
2002 - 2017 Mart Märdin
2018 - ... Siiri Plangi
Õppealajuhatajad:
1999 – 2000 Mart Õunpuu
2001 – 2011 Maia Popman
2011 - 2018 Siiri Plangi
2018 - ... Keiu Mäeots
Lennud:
1. lend – klassijuhataja Helgi Moisto 2001 (12 õpilast)
2. lend – klassijuhataja Ülle Lepp 2002 (7 õpilast)
3. lend – klassijuhataja Maia Popman 2003 (14 õpilast)
4. lend – klassijuhataja Maire Kobin 2004 (16 õpilast)
5. lend – klassijuhataja Tõnis Anton 2005 (17 õpilast)
6. lend – klassijuhataja Aimi Lessel 2006 (21 õpilast)
7. lend – klassijuhataja Helve Ruul 2007 (18 õpilast)
8. lend – klassijuhataja Meelis Reinberg 2008 (17 õpilast)
9. lend – klassijuhataja Maia Popman 2009 (13 õpilast)
10. lend – klassijuhataja Aimi Lessel 2010 (13 õpilast)
11. lend – klassijuhataja Tõnis Anton 2011 (16 õpilast)
12. lend – klassijuhataja Helve Ruul 2012 (12 õpilast)
13. lend – klassijuhataja Keiu Mäeots 2013 (24 õpilast)
14. lend – klassijuhataja Meelis Reinberg 2014 (19 õpilast)
15. lend – klassijuhataja Aimi Lessel 2015 (21 õpilast)
16. lend – klassijuhataja Katrin Koort 2016 (11 õpilast)
17. lend – klassijuhataja Helve Ruul 2017(13 õpilast)
18. lend – klassijuhataja Keiu Mäeots 2018 (17 õpilast)
19. lend – klassijuhataja Meelis Reinberg 2019 (16 õpilast)
20. lend – klassijuhataja Diana Kibal 2020 (20 õpilast)
21. lend - klassijuhataja 2021 (15 õpilast)
22. lend – klassijuhataja 2022 Anne Reiljan (20 õpilast)
Loe ka Puiga ajalugulink opens on new page.